Как только сообщение передано, серотонин отсоединяется и возвращается в синапс. Там серотонин либо расщепляется моноаминоксидазами (MAO), либо абсорбируется протеинами обратного захвата. Эти протеины отводят медиатор из синаптической щели обратно в терминаль исходного аксона.